Pour contrôler les mauvaises herbes, il existe de multiples alternatives au PARAQUAT. Des solutions spécifiques sont cherchées pour les différentes méthodes. On différencie notamment:

• Les méthodes préventives, qui empêchent aux mauvaises herbes de pousser, comme la culture sous couvert, la technique du paillis ou la rotation des cultures.
• Les méthodes culturales. Par une culture alternée (par exemple cultiver des haricots entre une culture de bananes) ou avec la technique des couvre sol (par exemple pour le café), les mauvaises herbes peuvent être parfaitement contrôlées.
• Les méthodes qui éliminent les mauvaises herbes présentes. Le désherbage à la main des mauvaises herbes ainsi que l'utilisation d'appareils et d'herbicides moins toxiques que le PARAQUAT en font partie.